Your question should be 많이와 많은...이 둘의 다른 점은 무엇인가요?
많(다) + 이(부사를 만드는 접미사) => 많이
이 is a suffix which make an adjective into an adverb
많이 is an adverb and used before verb.
많(다) + 은(앞말이 관형어 구실을 하게 하고 현재의 상태를 나타내는 어미) => 많은
은 is a suffix which make an adjective into a determiner
많은 is a determiner and used before noun.
Here are many apples.
여기에 많은 사과가 있어요. or 여기에 사과가 많이 있어요.
I ate many apples.
많은 사과를 먹었어요. or 사과를 많이 먹었어요.