Ambas son correctas, dependiendo del contexto.
Según la RAE (Real Academia de la Lengua Española), las dos formas son correctas.
- Juan se está riendo
- Juan está riendo
Sin embargo, cuando equivale a "burlarse de alguien o algo", siempre se emplea el modo reflexivo más DE:
- Juan SE está riendo DE su hermana.
O también:
- Juan está riéndose de su hermana.