本日のほうが丁寧な言葉で、今日は普通の言葉です。

意味は同じです。 「本日」→丁寧な言い方、ex. 本日は弊社の説明会にお越し頂きまして、誠にありがとうございます（企業説明会の挨拶）。 「今日」→日常的な言い方、ex.　今日は説明会があるから、帰りが遅くなるよ（家族との会話）。

本日は、その日の事で、何かの挨拶で使われることが多く、少しフォーマルな感じです。 例えば 本日は、お忙しい中、お越しいただきありがとうございます、など。 今日を＜きょう＞と読むと少しカジュアルで、＜こんにち＞と読むと、最近の話になります。 例えば 今日の予定は…＜きょう＞ 今日では、猫好きが増えています。<こんにち> ですね。