Ciao, l'uso del congiuntivo dopo "di quanto" è corretto, quindi è giusta la frase "Sei più intelligente di quanto tu creda".
Alcune persone nelle conversazioni informali spesso usano l'indicativo al posto del congiuntivo, come nell'esempio che hai fatto tu, ma è sbagliato. E' un errore piuttosto diffuso, quindi potresti sentirlo spesso, ma se vuoi parlare bene l'italiano dovresti continuare ad usare il congiuntivo.