Es dicil dar una respuesta que satisfaga a todos en este tema, pero trataré. Básicamente lo ha hecho ya el primer compañero que respondió a tu pregunta.
Comencemos por la forma más simple de oposiciones con el verbo ser, que utilizan en la inmensa mayoría de los casos dos formas indénticas conjugadas unidas por "como", "donde" o "lo que, por lo que", etc.
La primera es con el presente indicativo " es lo que es", "es como es", significa que sobre la identidad o la certeza del hehco, no se admiten más juicios ni dudas.
Luego podemos hacer frases con"era" "fuera", o inclusive "fue", pero siempre DOS FORMAS IGUALES, separadas por "como". "donde" " o lo que+ preposición.
>Fuera lo que fuera, me asutó mucho.
Fuera como fuera, el hecho es que llegaste a tiempo, y eso es lo importante<
Luego podeos usar el subjuntivo, "sea como sea" "fuese como fuese" "sea lo que sea", ·fuese por lo que fuese", ect, pero siempre dos formas idénticas y siempre ambas formas en el mismo modo.
No es correcto mezclar modos. No se puede decir " es como sea" o "sea lo que es" o "fuese como fuera" o " sea lo que fuese" por lo cual NO ES CORRECTO decir " sea como fuera", aunque en el lenguaje hablado se cometan ( y de hecho se cometen) toda clase de tropelías.