Oi Rilker, a pergunta é bastante interessante, porque realmente é muito comum ouvir a pronúncia "companía" ou até mesmo "compaía".
Mas eu só queria comentar aqui, que a pronúncia correta é mesmo "COMPANHIA". Ou seja, com aquele som nasal que a própria grafia sugere (ñ).
Então, independente da região, as outras pronúncias não são consideradas questão de simples sotaque, são consideradas desvios mesmo.
É a mesma coisa que acontece com as famosas e tão maltradas palavras "problema" e "gratuito", mesmo que muita gente não as pronuncie corretamente, não é questão de preferência.