Cantar dos en dos me suena como que quieres decir que cada dos alumnos, pares de alumnos, 2 para ser especifico van a cantar juntos. Dos en dos no me suena familiar, pero supondría que quieres decir " Every two students, each one next to each other, will sing this song" Agregué un par de detalles demostrando que cada par de alumnos por toda la sala, la persona que está a su lado, van a cantar juntos, en pareja digamos, para que la oracion sea mas clara. Es muy importante en inglés, y en cualquier idioma, no ser vago y no hacer generalizaciones con lo que dices..... Asi que, tal vez quiere decir " OK, two by two (dos por dos, literalmente) we are going to practice singing this song" Algo asi parece que va en la direcion requerida. Suerte. 8]