运作：This company/machine run smoothly. 运营：operating a company with skills.

you can only 运作 a machine, a project, but you can 运作or 运营 an enterprise.

I want to add to the two answers below, but you might have already noticed: the subject of 运作 is non-living object, while the subject of 运营 is a person.

对于这两个词，可以拆开分析它们的意思。 A.运作，是指运行和操作，指进行中的工作状态。 例句：1. 这个机器正在运作。 2. 这种同质化的商业运作模式，是对创意工作最大的扼杀。 3. 在生产运作中，我们对生产员有很高的要求。 B.运营，指运行和营业。 例句：1.这个游乐场还在运营中。2. 该集团通过其子公司,开发运营了超过85座热电站和水电站。

运营的营是营业的意思，跟商业活动有关的，一般用在公司、酒店这样的商业机构上。比如:公司业务运营良好。 运作的区别就是比较强调操作，比如:我在运作一个慈善项目。这个机器在正常运作。