Efectivamente el subjuntivo siempre forma parte de una frase subordinada o compuesta, por lo que la oración completa tendrá dos sujetos, el propio del verbo en subjuntivo, y el sujeto de la oración principal.
La expresión ¨me temo que¨ expresa seguridad y pena combinadas, no temor (aunque parezca lo contrario). Por lo tanto se ha de usar Indicativo y no Subjuntivo:
"Me temo que no PUEDO ir"= Malheureusement, je ne peux y aller.
Para expresar temor o duda es mejor usar "Tener miedo de..."
"Tengo miedo de que no PUEDA ir (de no poder ir)." = Je crains/J'ai peur de ne pas pouvoir y aller.