Lo que sucede es que en español no hay fórmulas fijas. Va a depender mucho de la intención del hablante y el significado que queremos transmitir. Los profesores enseñamos con ciertas reglas que se aplican en la mayoría de casos, no siempre son 100% generalizables. En el ejemplo que diste también es posible usarlo con el indicativo pero el significado cambiaría: LO MEJOR ES QUE hables con nativos. (Subjuntivo: porque el hecho de hablar con nativos aún no es una realidad, es algo que podría suceder o no) LO MEJOR ES QUE hablas con nativos. (Indicativo, significa que actualmente sí lo haces) ¿Qué pasa entonces con… LO BUENO ES QUE tiene carro (Indicativo, porque realmente tiene carro, se tiene la certeza) Al decir “lo bueno es que…” no nos da la posibilidad de hablar de un hecho que no sea real, a diferencia de “lo bueno sería que… tenga carro” en donde la palabra “sería” nos ofrece la posibilidad de hablar de un hecho que puede darse o no. Lo mismo sucede con “lo peor es que…”

LO MEJOR ES QUE... LO PEOR ES QUE... LO BUENO ES QUE... LO MALO ES QUE... En estas frases puedes utilizar perfectamente los tiempos del Modo Subjuntivo. El Modo Subjuntivo se utiliza con frecuencia en oraciones subordinadas que empiezan con la palabra QUE, pero no todas las oraciones con QUE necesitan subjuntivo.