En este caso, como en otros, se pueden usar los dos modos: indicativo y subjuntivo. Es otra de las dificultades del subjuntivo, los casos en que se puede usar o no. Pero esos casos sirven para comprender mejor su uso. Recuerda que el subjuntivo es el modo de la incertidumbre, la duda, el deseo...
1.- Con indicativo. El indicativo expresa certeza (afirmativa o negativa).
No ha comunicado que deja la empresa. El hablante SABE que Iñaki deja la empresa y que Iñaki no lo ha comunicado. Imagina la conversación.
a.- Iñaki me ha dicho que deja la empresa.
b.- Ya lo sé, pero todavía no ha comunicado que la deja.
2.- Con subjuntivo. El hablante DUDA de si Iñaki deja o no la empresa, el hablante no lo sabe seguro, pero sí SABE que no lo ha comunicado.
a.- Dicen algunos que Iñaki va a dejar la empresa.¿Será verdad?
b.- No lo sé, solo sé que él no ha comunicado que deje la empresa, quizás no lo ha decidido aún.