Las tres palabras se refieren al mismo espacio. La diferencia está en el uso.
La croqueta está bajo la mesa/debajo de la mesa.
Si usas bajo + algún sitio no necesitas preposición.
Si usas debajo tiene que añadir la preposición + de + algún sitio.
Las chicas están abajo (por ejemplo, en la calle). Voy a ir abajo a por agua. ¿A dónde? A la fuente.
Usas abajo como única referencia espacial, es decir, sin relacionarlo con algo específico de la espacio.